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Ergebnisse 1 - 1 von insgesamt 1 für "Biowissenschafter, Biowissenschafterin"
kompetenter MSc mit Praxis, sucht VZ in Bioinformatik, Molekularbiologie
ID: 68590|
Einsatzbereit ab: sofort|
Mobilitätsbereitschaft: Wien
Personal-Anbieter: CONTEXT Impulse am Arbeitsmarkt GmbH - akt:E
Strasse:
Quellenstraße 2c
PLZ:
1100
Ort:
Wien
Tel:
0664/3735279
www:
email:
Info:
kompetenter MSc mit Praxis, sucht VZ in Bioinformatik, Molekularbiologie
Qualifikation:
Kurzprofil:
Erfahrung in den Bereichen mikrobielle Genomik, Darmmikrobiom, Resistom und
Bioinformatik.
Fähigkeiten in der Gestaltung, Durchführung und Analyse ganzer metagenomischer, metatranskriptomischer und PacBio HiFi-Metagenomprojekte entwickelt, einschließlich Probenverarbeitung, Bibliotheksvorbereitung, Qualitätskontrolle, Sequenzierung und Datenanalyse, sowie fundierte Skriptkenntnisse in Bash, R und Python.
Fachkenntnisse:
* Bioinformatik:
• NGS-Datenanalyse: Datenvorverarbeitung, Qualitätskontrolle, Mapping/Assemblierung, funktionelle Annotation, Genexpression usw.
• Praktische Erfahrung in der Mikrobiomanalyse und mit Werkzeugen (Illumina und PacBio HiFi Reads), einschließlich funktioneller metagenomischer und metatranskriptomischer Analyse
• Umfangreiche Kenntnisse in der Analyse von 16S rRNA Amplikonsequenzierungsdaten
• Kenntnisse in der statistischen Datenanalyse und Visualisierung großer Datenmengen mit R/Bioconductor
• Wissenschaftliche Skriptsprachen wie Bash, R oder Python, Fähigkeit zur Implementierung und Änderung von Metagenomik-Pipelines.
• Versteht bioinformatische Konzepte, Datenbanken und Werkzeuge
• Kenntnisse in der Arbeit mit leistungsstarken Linux-Clustern
* Molekulare Mikrobiologie:
• DNA- und RNA-Isolierung aus Stuhl, Erde, Hühnern, Schweinen und Menschen mithilfe handelsüblicher Kits.
• Reinheit, Integrität und Quantifizierung von DNA und RNA mittels Nanodrop, Qubit, Gelelektrophorese und Bioanalyzer.
• RT- qPCR-Tests wurden entwickelt/modifiziert, um die Effizienz/Stabilität der bakteriellen DNA/RNA-Extraktion oder die gesamte bakterielle Belastung bzw. Wirtskontamination basierend auf dem 16S-rRNA-Gen und den HKG-Genen zu messen.
• Vorbereitung, Quantifizierung und Validierung von 16S rRNA- und Shotgun-
Metagenombibliotheken.
• Herstellung verschiedener Medien, die für das Wachstum und die selektive Isolierung unterschiedlicher Mikroorganismen geeignet sind.
• Zur Identifizierung wurden verschiedene biochemische Tests und Färbemethoden an Mikroorganismen durchgeführt
Erfahrung in den Bereichen mikrobielle Genomik, Darmmikrobiom, Resistom und
Bioinformatik.
Fähigkeiten in der Gestaltung, Durchführung und Analyse ganzer metagenomischer, metatranskriptomischer und PacBio HiFi-Metagenomprojekte entwickelt, einschließlich Probenverarbeitung, Bibliotheksvorbereitung, Qualitätskontrolle, Sequenzierung und Datenanalyse, sowie fundierte Skriptkenntnisse in Bash, R und Python.
Fachkenntnisse:
* Bioinformatik:
• NGS-Datenanalyse: Datenvorverarbeitung, Qualitätskontrolle, Mapping/Assemblierung, funktionelle Annotation, Genexpression usw.
• Praktische Erfahrung in der Mikrobiomanalyse und mit Werkzeugen (Illumina und PacBio HiFi Reads), einschließlich funktioneller metagenomischer und metatranskriptomischer Analyse
• Umfangreiche Kenntnisse in der Analyse von 16S rRNA Amplikonsequenzierungsdaten
• Kenntnisse in der statistischen Datenanalyse und Visualisierung großer Datenmengen mit R/Bioconductor
• Wissenschaftliche Skriptsprachen wie Bash, R oder Python, Fähigkeit zur Implementierung und Änderung von Metagenomik-Pipelines.
• Versteht bioinformatische Konzepte, Datenbanken und Werkzeuge
• Kenntnisse in der Arbeit mit leistungsstarken Linux-Clustern
* Molekulare Mikrobiologie:
• DNA- und RNA-Isolierung aus Stuhl, Erde, Hühnern, Schweinen und Menschen mithilfe handelsüblicher Kits.
• Reinheit, Integrität und Quantifizierung von DNA und RNA mittels Nanodrop, Qubit, Gelelektrophorese und Bioanalyzer.
• RT- qPCR-Tests wurden entwickelt/modifiziert, um die Effizienz/Stabilität der bakteriellen DNA/RNA-Extraktion oder die gesamte bakterielle Belastung bzw. Wirtskontamination basierend auf dem 16S-rRNA-Gen und den HKG-Genen zu messen.
• Vorbereitung, Quantifizierung und Validierung von 16S rRNA- und Shotgun-
Metagenombibliotheken.
• Herstellung verschiedener Medien, die für das Wachstum und die selektive Isolierung unterschiedlicher Mikroorganismen geeignet sind.
• Zur Identifizierung wurden verschiedene biochemische Tests und Färbemethoden an Mikroorganismen durchgeführt
Praxis:
* NGS/Microbiome Wissenschaftlicher Mitarbeiter
• Konzeption, Betreuung und Durchführung von NGS-/Mikrobiom-Experimenten (einschließlich Nasslabor und Datenanalyse).
• Bioinformatische Analyse mikrobieller DNA-/RNA-Sequenzdaten: Qualitätskontrolle (QC), Mapping,
Assembly, Annotation, Genexpressionsanalyse, Statistik und Visualisierung.
• Erforschung des Darm-Resistoms – mit Schwerpunkt auf der Expression von Antibiotikaresistenzgenen (ARGs) und der Rolle mobiler genetischer Elemente (MGEs) bei der Ausbreitung von Antibiotikaresistenzen (AMR) im Darm von Nutztieren –, um wirksame Strategien zur Verringerung der durch ARGs für die menschliche Gesundheit und die Umwelt ausgehenden Bedrohung zu entwickeln.
• Identifizierung und Charakterisierung genomischer Variationen in Pathogen-Genomen.
* Wissenschaftlicher Mitarbeiter
• Entwicklung einer optimierten Pipeline für die Probenentnahme, Stabilisierung,DNA-/RNA-Isolierung, Quantifizierung, Bibliotheksvorbereitung und bioinformatische Analyse von
Nutztieren zur Sequenzierung und Analyse des Darmmikrobioms in höchster Qualität im Hochdurchsatzverfahren
• Untersuchung der Dynamik und Verbreitung von Antibiotikaresistenzgenen im
Darmmikrobiom von Hühnern, die Antibiotika als Wachstumsförderer, Therapeutika und phytogenen Futterzusatz erhalten, mittels Whole Shotgun-Metagenom- und
Metatranskriptom- Sequenzierung
• Die Untersuchung der Wirksamkeit der neuen Futterzusätze bei Hühnern zielte darauf ab, die Selektion und Verbreitung von Antibiotikaresistenzen zu reduzieren
• Metagenomische Sequenzierung von HiFi-Langdaten, um das Verständnis der taxonomischen und funktionellen Zusammensetzung des Hühnerdarmmikrobioms zu verbessern und eine genomische Referenz für das Hühnermikrobiom zu schaffen
* Wissenschaftliche Hilfskraft/Masterarbeit
• Untersucht wurde der Abbau von polyzyklischen aromatischen Kohlenwasserstoffen (PAK) durch einheimische Mikrobiota und die dynamischen Konzentrationsänderungen in einem kontaminierten Boden, der mit organischen Bodenverbesserungsmitteln angereichert wurde, sowie die Auswirkungen von PAK auf die Bakterienpopulation, den Reichtum, die Vielfalt und die Veränderungen der Gemeinschaftsstruktur.
• Zu den Methoden gehörten DNA-Isolierung, DNA-Quantifizierung mit Nanodrop, Qubit, Gelelektrophorese und Bioanalyzer. Anschließend wurde eine 16S-rRNA-Genbibliothek vorbereitet, einschließlich Amplikon-PCR, Index-PCR, PCR-Reinigung, Bibliotheksvalidierung mit Bioanalyzer, qPCR und Sequenzierung auf der Illumina- MiSeq -Plattform. Rohdaten wurden mithilfe der QIIME2-Pipeline analysiert und die statistische Analyse wurde in
R/Bioconductor durchgeführt.
* Medizinischer Vertriebsmitarbeiter
• Besuche in Krankenhäusern, Generierung von Verkäufen durch Vorführung oder Präsentation von Medikamenten und Sicherstellung einer effektiven Abdeckung der Zielärzte und -apotheken
• Aufbau und Pflege guter Geschäftsbeziehungen mit dem Krankenhaus-Gesundheitswesen,
um Wiederholungskäufe zu fördern
• Nachverfolgung der vom Unternehmen generierten Leads
• Durchführen von CRM-Aktivitäten gemäß Werbeplan
• Pflege der Kundendatenbank und Sicherstellung einer effektiven Abdeckung zur Zielerreichung
• Überwachen Sie die Verkaufsergebnisse anhand des Kundenfeedbacks und ergreifen Sie bei
Bedarf Korrekturmaßnahmen.
• Teilnahme und Organisation von Fachausstellungen, Konferenzen und Tagungen
• Konzeption, Betreuung und Durchführung von NGS-/Mikrobiom-Experimenten (einschließlich Nasslabor und Datenanalyse).
• Bioinformatische Analyse mikrobieller DNA-/RNA-Sequenzdaten: Qualitätskontrolle (QC), Mapping,
Assembly, Annotation, Genexpressionsanalyse, Statistik und Visualisierung.
• Erforschung des Darm-Resistoms – mit Schwerpunkt auf der Expression von Antibiotikaresistenzgenen (ARGs) und der Rolle mobiler genetischer Elemente (MGEs) bei der Ausbreitung von Antibiotikaresistenzen (AMR) im Darm von Nutztieren –, um wirksame Strategien zur Verringerung der durch ARGs für die menschliche Gesundheit und die Umwelt ausgehenden Bedrohung zu entwickeln.
• Identifizierung und Charakterisierung genomischer Variationen in Pathogen-Genomen.
* Wissenschaftlicher Mitarbeiter
• Entwicklung einer optimierten Pipeline für die Probenentnahme, Stabilisierung,DNA-/RNA-Isolierung, Quantifizierung, Bibliotheksvorbereitung und bioinformatische Analyse von
Nutztieren zur Sequenzierung und Analyse des Darmmikrobioms in höchster Qualität im Hochdurchsatzverfahren
• Untersuchung der Dynamik und Verbreitung von Antibiotikaresistenzgenen im
Darmmikrobiom von Hühnern, die Antibiotika als Wachstumsförderer, Therapeutika und phytogenen Futterzusatz erhalten, mittels Whole Shotgun-Metagenom- und
Metatranskriptom- Sequenzierung
• Die Untersuchung der Wirksamkeit der neuen Futterzusätze bei Hühnern zielte darauf ab, die Selektion und Verbreitung von Antibiotikaresistenzen zu reduzieren
• Metagenomische Sequenzierung von HiFi-Langdaten, um das Verständnis der taxonomischen und funktionellen Zusammensetzung des Hühnerdarmmikrobioms zu verbessern und eine genomische Referenz für das Hühnermikrobiom zu schaffen
* Wissenschaftliche Hilfskraft/Masterarbeit
• Untersucht wurde der Abbau von polyzyklischen aromatischen Kohlenwasserstoffen (PAK) durch einheimische Mikrobiota und die dynamischen Konzentrationsänderungen in einem kontaminierten Boden, der mit organischen Bodenverbesserungsmitteln angereichert wurde, sowie die Auswirkungen von PAK auf die Bakterienpopulation, den Reichtum, die Vielfalt und die Veränderungen der Gemeinschaftsstruktur.
• Zu den Methoden gehörten DNA-Isolierung, DNA-Quantifizierung mit Nanodrop, Qubit, Gelelektrophorese und Bioanalyzer. Anschließend wurde eine 16S-rRNA-Genbibliothek vorbereitet, einschließlich Amplikon-PCR, Index-PCR, PCR-Reinigung, Bibliotheksvalidierung mit Bioanalyzer, qPCR und Sequenzierung auf der Illumina- MiSeq -Plattform. Rohdaten wurden mithilfe der QIIME2-Pipeline analysiert und die statistische Analyse wurde in
R/Bioconductor durchgeführt.
* Medizinischer Vertriebsmitarbeiter
• Besuche in Krankenhäusern, Generierung von Verkäufen durch Vorführung oder Präsentation von Medikamenten und Sicherstellung einer effektiven Abdeckung der Zielärzte und -apotheken
• Aufbau und Pflege guter Geschäftsbeziehungen mit dem Krankenhaus-Gesundheitswesen,
um Wiederholungskäufe zu fördern
• Nachverfolgung der vom Unternehmen generierten Leads
• Durchführen von CRM-Aktivitäten gemäß Werbeplan
• Pflege der Kundendatenbank und Sicherstellung einer effektiven Abdeckung zur Zielerreichung
• Überwachen Sie die Verkaufsergebnisse anhand des Kundenfeedbacks und ergreifen Sie bei
Bedarf Korrekturmaßnahmen.
• Teilnahme und Organisation von Fachausstellungen, Konferenzen und Tagungen
Schule:
* Doktor der Naturressourcen und Biowissenschaften - Dr.nat.techn (PhD) - laufend
* Master in Biomedizintechnik und Biomedizin
* Bachelor der Pharmazie
Sprachen:
* English - C1 ausgezeichnet
* Deutsch - B1 gut
Förderung dieses Vollzeit-Mitarbeiters möglich!
* Master in Biomedizintechnik und Biomedizin
* Bachelor der Pharmazie
Sprachen:
* English - C1 ausgezeichnet
* Deutsch - B1 gut
Förderung dieses Vollzeit-Mitarbeiters möglich!
Alter:
37
Geschlecht:
männlich
Deutsch-Kenntnisse:
gut
Mobilitätsbereitschaft:
Wien
Führerschein:
B
